Nakon što su odigrane utakmice pretkola poznati su i parovi šesnaestine finala Hrvatskog nogometnog kupa koje je na rasporedu u srijedu, 22. rujna, 2021. godine.
U ovoj fazi natjecanja igra se na samo jedan susret i to na način da je domaćin klub koji nije nositelj.
Za istarski nogomet koji ima dva predstavnika najvažniji su susreti Rudar Trans Eura koji će za protivnika u Labinu imati RNK Split, dok će Istra 1961 gostovati ili u Vukovaru ili u Biogradu što će biti određeno ždrijebom.
U ostalim susretima sastaju se Pitomača – Rijeka, Orijent 1919 – Dinamo, Dugopolje – Lokomotiva, Bednja – Osijek, Vuteks Vukovar / Primorac Biograd – Hajduk, Karlovac 1919 – Slaven Belupo, Mladost Ždralovi – Inter-Zaprešić, Nehaj Senj – Gorica, Međimurje – Šibenik, Belišće – Vinogradar, Bjelovar – Rudeš, Sesvete – Varaždin, BSK Bijelo Brdo – Cibalia te Zagreb – Oriolik
